Η διαδικασία απιονισμού αφαιρεί τα ιόντα από το νερό μέσω ανταλλαγής ιόντων. Τα θετικά φορτισμένα ιόντα και τα αρνητικά φορτισμένα ιόντα (ανιόντα) ανταλλάσσονται με ιόντα υδρογόνου (Η+) και υδροξυλίου (ΟΗ-), αντίστοιχα, λόγω της μεγαλύτερης συγγένειας της ρητίνης με άλλα ιόντα.